Hola, si he entendido bien...  Para acceder a un método que se encuentra en una clase diferente a la que lo desea invocar, debes realizar una instancia de la misma
Quedaría así
package utilidades;
public class Probabilidad {
  public Probabilidad() {
  }  
  public double calcular_probabilidad()
{
    double num=(double)(1*Math.random());
    System.gc();
    return num;
   }
}
CLASE PRINCIPAL
package utilidades;
public class otraClase {
  public otraClase() {
  }  
  public void llamarMetodoCalcular_probabilidad()
{
   Probabilidad instanciaClaseProbabilidad = new Probabilidad();
   double valorDouble = instanciaClaseProbabilidad.calcular_probabilidad();
   System.out.println(valorDouble);
   }
  public static void main(String[] args) {
    otraClase otraClase1 = new otraClase();
    otraClase1.llamarMetodoCalcular_probabilidad();
  }
}
***********************
Saludos!!   
