Cuando creas la lista desplegable con
<select name="cmbmaterias" id="cmbmaterias">estás creando una variable para php que con el nombre
$cmbmaterias que guarda la selección hecha por el usuario. Luego sólo accedes al valor de esa variable para realizar la otra consulta:
$OTRA_query= "SELECT cat_grupos.grupo FROM cat_grupos, cat_materias
WHERE nombre_materia=
'$cmbmaterias' and cat_materias.cve_materia=cat_grupos.materia
order by grupo"