Hola chema, no se si verás este mensaje porque ya hace mil que publicaste tu duda.
No se ve el archivo que has colgado, de todas formas en la red que estás utilizando ¿no utilizas muy pocas neuronas?, creo que el error podria producirse ahi, aunque no he visto el codigo, por tanto es un poco predicción lo que te digo. Por el tema de los pesos, ¿cuantas entradas utilizas por neurona?, debes comprobar que en el entrenamiento de la red, tienes que ir suprimiendo una a una las entradas para ver el desgaste de los datos, la entrada que más desgaste el dato al ser quitada será la más importante.
Por último la feedForward funciona com medias ponderadas de las entradas respecto a las salidas, ¿tienes la neurona de tu última capa haciendo la media ponderada a su salida de la entrada que más relebancia tiene?, es el método más rápido para tenerla entrenada.