Hola Daniel.
En verdad debo estar espeso, porque sigo sin ver la trasparencia a que te refieres por ningún lado...
De todas formas, para conseguir algun efecto de fondo transparente (por ejemplo que como fondo de las diferentes fichas del tabstrip aparezca el escritorio), podrías hacer lo siguiente:
Usa PictureBox en lugar de Frames como contenedor para cada una de las fichas. Cuando vayas a hacer visible uno o otro contenedor, calcula las coordenadas relativas al ancho y alto de la pantalla (screen.Width, Screen.Height) , copia al PictureBox (BitBlt) la porción de la imagen de fonfo que corresponda al tamaño y posición del contenedor.
Aunque la verdad, no sé si es algo así lo que buscas...
Suerte.
