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sin caer en lo obvio, el banco debe informarle a la aplicación que imprime cupones.

si es un contrato,debieron "exigir una interface" algo tan simple como un archivo plano, que lo envien al final de dia y tu carges a tu sistema para actualizar los estado de los pagos o algo tan funcional como un webservice que cada vez hagan un pago en el banco envie un mensaje al sistema de cupones con el pago realizado.

si es una asignacion de la uni o el cole. lo mismo de arriba, minimo necesita 2 programas, uno que cree las facturas y otro que sirva para pagarlas.

no creas con un sftp, es lo suficientemente factible, el unico downside es que no es online. anyway, para el webservice, dependera bastante de la infra-estructura del banco, si ellos usan .net, es posible que prefieran hacerlo en punto.net.

todo depende, por lo que si te toca hacer ese proyecto, lo mas factible es reunirse con el banco y planear las opciones. ya de ahi implementar.