La verdad eso no nos dice mucho.  
 
 ¿Cómo estas compilando los programas ? 
¿ Estás utilizando algún IDE ? 
¿ Qué error te arroja cuando intentas compilar ?
Por cierto, con el JRE (Java Runtime Environment) no puedes compilar, tan solo puedes ejecutar los programas ya compilados; para eso necesitas el JDK (Java Developer Kit).
No lo tomes a mal, tan solo especifica un poco más tu problema 
