La verdad eso no nos dice mucho.
¿Cómo estas compilando los programas ?
¿ Estás utilizando algún IDE ?
¿ Qué error te arroja cuando intentas compilar ?
Por cierto, con el JRE (Java Runtime Environment) no puedes compilar, tan solo puedes ejecutar los programas ya compilados; para eso necesitas el JDK (Java Developer Kit).
No lo tomes a mal, tan solo especifica un poco más tu problema