prueba con la función
list ;esta creo recordar que te muestra una lista con todos los archivos contenidos en el directorio que hayas asignado. Depues puedes hacer un bucle for para recorrer todos y con if ver si está, sería mas o menos así:
a=list;
encontrado=0:
b=input('introduzca el nombre del archivo:')
for i=1:length(a)
if a(i)==b
encontrado=1
break
end
end
De este modo si encontrado es 1 es que el archivo existe si es 0 que no
