Hola.
Para empezar, por normas de escritura, cuando inicias un parrafo después de un título, éste no debe de llevar sangría, debido a eso, LATEX no pone la sangría inicial, ya que no es la estructura correcta de un documento. Pero si tu insistes en poner una sangría que no debería de ir, lo que puedes hacer es dejar tantos espacios como creas que son necesarios.
LATEX viene configurado para seguir lineamientos estándares, por lo que deja espacios grandes al iniciar un capítulo y así mismo, te pone la palabra Chapter para indicar un nuevo capítulo.
Hay gente que se ha dedicado a modificar ciertos comportamientos de LATEX y generan plantillas, podrías buscar en internet, posiblemente encuentres alguna que se adapte a tus necesidades o gustos, pero también podrías crear tu propia plantilla a tu gusto, claro que para ello, ya debes conocer muy a fondo lo que es LATEX y aparte, comocer TEX que es con lo que diseñarías tus plantillas.
Espero te haya ayudado en algo.
Hasta luego.