Hola.
Por lo que mencionas, si has de tener un virus.
Por lo general, actualmente han aparecido virus que te crean una carpeta llamada RECYCLER y te la ponen como oculta, en esta carpeta el virus tiene cierta información para propagarse o autogenerarse cuando es eliminado por un antivirus, hay varios antivirus que te detectan el virus, pero no te eliminan la carpeta RECYCLER.
Es recomendable escanearlo con un virus actualizado y en caso de que no te borre esa carpeta, la deberas borrar manualmente. También te recomiendo que revises las memorias o celulares que conectas, ya que estas pueden estsar infectados y el virus se propaga al momento en que exploras tus medios extraibles, ya que ademas tienen un archivo autorun.inf que es el que proboca la propagación.
Espero sirva de ayuda.
Hasta luego.