Generalmente se hace por medio de FTP, cuando contratas el servicio, ellos te dan la direccion del servidor FTP, ademas de un nombre de usuario y contraseña para el mismo, que deberas utilizar para conectarte con un programa de FTP, te recomiendo FileZilla, es muy bueno.
Ademas tambien te daran nombre de usuario y contraeña para tu base de datos, claro, siempre y cuando el servicio que contrates inluya un servidor de base de datos.
Cada vez que modifiques el codigo fuente de tu pagina web, tendras que volver a subir por FTP aquellos archivos que hayas modificado.
Espero que con eso se te aclaren las dudas.
Saludos
