No lo indicas pero de seguro usas DAO, especificamente el Data Control, ya que en caso de ser así, el problema es debido a que no has actualizado el MDAC que puedes descargar de la web de Microsoft.
Mientras no arregles eso, DAO no podrá enlazarse a una BD Access2000 porque él que tienes, sólo entiende el motor jet 3.51 y 3.6 (Access 97), mientras que Access2000 utiliza el motor jet 4.0.
Debes bajarte el MDAC 2.7 para que DAO pueda interactuar y entender al Access2000. Mientras no soluciones eso, DAO no podrá trabajar con BD superiores a la versión 97 de Access.
Saludos