La solucion ya te la dieron, te falta un else, esa es la razon, al faltar el else se toma como 2 if separados, y no anidados, entonces, en el primer if, si el numero es menor, imprime que el numero es menor, y al llegar al segundo if, pregunta si es mayor, y como no es mayor, no imprime el mensaje de "es mayor" PERO como tiene un else, el else del segundo if se cumple si el numero es menor o igual, asi que vuelve a imprimir el mensaje.
Si aun sigues sin entender porque, entonces te recomiendo que estudies sobre los if anidados, y que le preguntes a tu maestro y que te haga una corrida de escritorio, asi comprenderas mejor porque.
