Hola, solucionado. Os dejo el codigo por si os interesa:
Dim popupScript As String = "<script language='JavaScript'>" & _
"window.open('MostrarFotosNew.aspx?Codigo= " & LabelCodigo.Text & _
"', '', 'width=400, height=400, menubar=no, resizable=no," & _
"scrollbar=no, toolbar=no, top=25, left=25')" & _
"</script>"
ClientScript.RegisterClientScriptBlock(Me.GetType(), "MostrarFotos", popupScript)
Este codigo se pone en el procedimiento que maneja el evento click del boton.
Saludos