Por lo que dices, parece que el servidor está trabajando en
Safe Mode o modo seguro con lo cuál algunas funciones están deshabilitadas o restringidas. En tu caso imagino que debes estar utilizando las funciones
copy o
move_uploaded_file en tu script.
Si tienes acceso a la configuración del servidor deberías modificar la directiva
open_basedir en el fichero
httpd.conf de Apache para indicar bajo qué directorio/s deseas permitir operaciones con ficheros.
Si no tienes acceso a la configuración del servidor tendrías que pedirle al administrador que dé permisos a tu directorio en el fichero de configuración.
Espero que te sirva.
Salu2,
Avalon