Hola, nunca me toco hacer algo así, pero el powerbuilder trae una herramienta de migración. Al menos, en la versión 9, te vas a file->new... y te abre una ventanita donde seleccionas que es lo nuevo que querés. La última solapa (la que dice "tool") tiene el "Migration Assistant".
Probá de hacerlo con eso, igual chequeate todo el funcionamiento del sistema (al menos las operaciones más usadas).
Que tengas suerte, saludos.