No sé si se maneja igual que con los diskette. Antiguamente cada diskette de instalación traía un archivo que indicaba el cambio de disco (disk1,disk2,...etc). Un método que funcionaba era copiar el contenido de los diskette en una sola carpeta, es decir revolviendo todos los contenidos de los discos en una sola ubicación, así se instalaba de corrido.
Sin embargo, también he probado copiando instaladores multiCD en disco duro, insertando una carpeta por cada disco y llamándolos igual, variando sólo la terminación (disco1, disco2,..., discoN) y copiando el contenido de los CD en su respectiva carpeta siguiendo el mismo orden.
Pienso que debe funcionar de la misma manera. Lo que si no aseguraría es que inicie con autorun, o por lo menos no lo creo conveniente.
En conclusión, habría que hacer la prueba con ambos casos: revolviendo ó separando por carpetas.
Muchos Éxitos, Salu2 y Chao!