Para trabajar con archivos tienes que conocer las funciones para manejo de archivos que vienen con la librería estándar declaradas en <stdio.h>, o conocer los flujos estándar de entrada y salida cuyas clases viene declaradas en <iostream.h>.
Por otra parte, buscar el comando específico que quieres y modificarlo depende de como esté estructurado el archivo en el cual se encuentra este comando. ¿Es un archivo de texto plano, sin estructura (los comúnmente con extensión .TXT)? ¿o, por el contrario, es un archivo de texto con campos fijos, donde, por ejemplo, el nombre del comando, su descripción y los ejemplos sean de un tamaño fijo?
Puedes usar la función strstr, declarada en <string.h> para buscar el comando en una línea de texto.