Hola que tal
a ver no recuedo la instruccion exacta en este momento, pero dale a la ayuda y busca por : compiler
ahi hay unas instrucciones que convierten hacia c y ademas puedes generar una aplicacion stand alone (que se ejecuta sin el entorno de matlab),
lo malo es que necesitas tener bien configurado tanto el matlab como el C, una vez lo pude hacer pero luego reinstale y el matlab me empezo a mandar un codigo de error, (por cierto ya no lo he intentado otra vez)