El MySQL funciona mejor estando instalado como un servicio en windows de tipo NT como Win 2000 o XP, y en windows 98 no es posible tener servicios en este caso se instala como una aplicacion, lo recomendable es ke centralices la información en un ekipo con win 2000 o xp con mysql instalado y ke los demas ekipos con win 98 o el ke sea se conecten a este por medio de la red.
si las makinas no estan en red y cada una trabaja de forma independiente entonces verifica ke tu makina con win98 tenga el mysql instalado como aplicacion y no como servicio sino es eso verifica tu conector ke me imagino debe ser el de odbc, si no es nada de eso entonces lo mas recomendable y para kitarte de pexs es kitar el nche win98 y pongas win 2000 si la makina ya anda medio vieja o win xp si lo awanta.
Saludos.
