Hola Cee, te explico, es sencillo:
paso 1: abres el fichero jpg como binario, lees byte x byte, lo imprimes en un fichero de normal, vas a ver que te aprecen los numeros que corresponden a los simbolos de dicho fichero, en estos bas a ubicar donde empieza el fichero, cual es la cabecera del fichero y veras mas abajo la combinacion de colores RGB, es decir veras donde empieza el grupo de 3 numeros que indica la combinacion de colores, de esta manera veras cuando pone negro y cuando es blanco, cogiendo por grupos de 3. Luego lo comparas con las del otro fichero.
paso 2: tener en cuenta que ambas imagenes tienen la misma dimencion, para lo cual es mas facil al busqueda si le das coordenadas a la imagen. es decir cada n pixeles, lo asignas como 1, y sucecivamente, de esta manera lo unico que haces luego es compara leyendo solo una imagen con la segunda, en la misma coordenada, utilizando el metodo ya explicado.
Espero e sirva de algo.