Hola, usa esta función: glReadPixels();
y Funciona así:
glReadPixels(0,0,sw,sh,format,GL_UNSIGNED_BYTE,pdata);
donde los primeros 2 parametros indican el valor de ventana inicial, los otros 2 los valores finales de posicion de tu ventana, el format indica si vas a leer rgb o rgba, el penultimo indica en qué tipo de datos vas a guardar los colores y el ultimo es un arreglo para guardar lo que leiste.
En tu caso sería algo así:
unsigned char colores[3];
glReadPixels(0,0,1,1,GL_RGB,GL_UNSIGNED_BYTE,colores);
Y listo.
Espero que esto te ayude.
http://www.openglubb.info
