Hola;
Simplemente, no se puede.
Para eso utiliza php, asp, en modo localhost, con servidor de apache y el resto como MySql, php.
Tienes una serie de funciones para crear texto, directorias, mover, borrar, etc.
Lo otro sería, copiar del textarea al portapapeles y despues insertar en el notepad cuando lo inicias.
Nos vemos.