Linux tiene su compilador, debes compilar por comandos en modo consola(por si acaso el modo consola de Linux es como el DOS de Windows),vas al directorio que contiene tu codigo fuente y ahi:
Un ejemplo:
gcc miprograma.c -o miprograma.exe
donde miprograma.c es la fuente, y miprograma.exe es el archivo compilado, bueno te recomiendo que busques en un buscador mas acerca de esto.
Suerte