Bueno, pues buscando por el google he encontrado una solución a mi problema, ahí dejo la respuesta por si le puede servir a alguien:
#include <windows.h>
Sleep(1000); //milisegundos
De todos modos me queda una duda, que es si se podría usar esta función en linux, o que se llame "windows.h" no tiene que ver con este tipo de compatibilidad entre Linux y Windows?